Från att du har levererat din ansökan går det en period på ca 2 månader till att beslut fattas. Under den här perioden bereder sekretariaten ansökningar för Styrkommittén/Övervakningskommittén, som möts 2 gånger årligen. Först går sekretariaten igenom om ansökan uppfyller de tre grundläggande kraven. Om något av dessa ej är uppfyllt får projektet ett meddelande om att ansökan ej är komplett och därför ej kommer att behandlas.

Om ansökan uppfyller de grundläggande kraven behandlas ansökan och bedöms utifrån de 7 urvalskriterierna efter en skala med bedömningarna "svagt", "starkt" eller "mycket starkt". Om mer än hälften (4 av 7) av urvalskriterierna bedöms vara "starka" eller "mycket starka" kan sekretariaten rekommendera projektet för godkännande till styrkommittén eller övervakningskommittén. Om ett projekt inte uppfyller tillräckligt många urvalskriterier, rekommenderas det för avslag till Styrkommittén/Övervakningskommittén.  

Sekretariaten gör därefter ett förslag till beslut som bygger på innehållet i ansökan med sekretariatens kommentarer. Förslaget skickas till Styrkommittén för respektive delprogram eller till Övervakningskommittén. Övervakningskommittén gör urval av projekt som löper på tvärs över de två delprogrammen (Öresund-Kattegat-Skagerrak-projekt). Ärendehanteringsprocessen för Öresund-Kattegat-Skagerrak-projekt är den samma som för Öresund och Kattegat/Skagerrak-projekt. Sekretariatskontoren har en dialog omkring alla projekt innan förslag till beslut skickas.

Omedelbart efter att kommittéerna har fattat beslut ger sekretariaten besked till Lead partner/Norsk prosjekteier, som erhåller ett mail med besked om kommittéernas motivering till beslut. Förvaltande Myndighet och Norsk Förvaltande Organisation utarbetar ett formellt avslagsbrev eller beslutsbrev för bifall med Styrkommitténs/Övervakningskommitténs motivering till beslut. Beslutsbreven innehåller tidsram för projektet (start och slutdatum), samt det maximala stödbeloppet från programmet. Beslutsbreven ska undertecknas av Lead Partner och Norsk Prosjekteier och returneras till Förvaltande Myndighet eller Norsk Förvaltande Organisation och de är grundlag för kontraktet mellan Lead Partner/Norsk Prosjekteier och Interreg IVA – programmet. Det rekommenderas att Lead Partner och Norsk Prosjekteier skickar en kopia av besluten och de allmänna villkoren till samtliga partners i projektet.